提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。
全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
春节期间武汉归元寺实行线上购票预约入寺******
中新网武汉1月16日电 (记者 张芹)今年武汉归元寺调整购票入寺规定,实行线上购票、人员限流管理等措施。春节期间,归元寺夜间不对外开放。
记者从16日召开的“汉阳区2023年春节期间归元寺民俗文化活动新闻通气会”上获悉,春节期间,归元寺开放时间为1月22日(正月初一)至1月27日(正月初六)6时至18时,1月28日(正月初七)至2月5日(正月十五)8时至17时。
值得注意的是,今年春节期间,归元寺夜间不开放,尤其是大年三十夜间、正月初四夜间,禁止入寺敬香。
春节期间归元寺核心区域交通管制范围 汉阳区交通大队供图此外,今年归元寺实行线上购票、分时段预约管理。不设线下售票点,每日限售5万张电子票。市民、游客可提前通过“武汉归元禅寺”微信公众号线上预约购票,每人限购3张票,线上预约2小时为一时段,需按照预约时间段入寺。
入寺两个验票卡口分别设置在西桥路和归元寺南路。预约成功者携带手机,按路标指示牌和现场工作人员提示扫码验票。未进行网上预约购票或未按照预约时间段验票的不得入内。
归元寺继续倡导文明敬香,三支线香礼佛。严禁将高香、捆香、黄纸、蜡烛、天灯、氢气球等危险物品带入寺内,以免引发危险。禁止在寺院外及周边道路上焚烧香蜡,严禁燃放烟花爆竹,对违规者将依法处理。
春节期间,归元寺周边多路段将实施交通管制,外来车辆不得进入,请广大市民、游客尽量乘坐公共交通按时前往归元寺,避免错过入寺时间。(完)
(文图:赵筱尘 巫邓炎) [责编:天天中] 阅读剩余全文() |